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独特的基因特征可以帮助预测对化疗的反应

导读 弗朗西斯·克里克研究所(Francis Crick Institute)的研究人员开发了一种方法,可以帮助预测肺癌患者是否会对化疗产生反应,这是基于肿瘤

弗朗西斯·克里克研究所(Francis Crick Institute)的研究人员开发了一种方法,可以帮助预测肺癌患者是否会对化疗产生反应,这是基于肿瘤中开启的基因。

近年来,癌症研究人员增加了我们对特定基因突变如何影响肿瘤如何发展,进化和对治疗反应的理解。然而,仅存在突变并不能提供肿瘤生物学的完整图像。

在本周发表在《自然通讯》上的研究中,科学家们研究了肿瘤内不同基因的表达,哪些基因是打开还是关闭的。

研究人员专注于与RAS信号通路相关的基因,分析了包含这些基因在癌细胞中活性信息的数据集。从这些数据集中,在人工智能的帮助下,他们编译了84个基因的独特基因特征。

当科学家们回顾性地观察500多名已经接受过治疗的肺癌患者的数据时,基因特征能够正确预测哪些患者会从化疗中受益,哪些患者不会从化疗中受益。

Sophie de Carné是克里克肿瘤基因生物学实验室的共同主要作者和博士后研究科学家,他说:“随着许多癌症疗法的提供,以及更多的药物正在试验中,预测哪种治疗方法对特定患者的成功机会最高是一个挑战。因为我们知道RAS信号传导参与各种耐药性机制,我们希望我们的基因特征将有助于确定可以从特定疗法中受益的患者群体。

“与此同时,要实现这一目标,还有很多工作要做。它需要在试验环境中进行测试,我们也在对其进行调整,希望使其更易于部署。

克里克肿瘤基因生物学实验室的共同主要作者和主要组长Julian Downward说:“我们的研究表明,RAS信号通路是解释为什么肺癌患者对化疗有不同反应的关键因素。该途径中的基因表达水平比某些基因突变的存在更具决定性,包括KRAS基因的突变。

克里克大学生物信息学和生物统计学平台的第一作者兼副主任菲利普·伊斯特(Philip East)补充说:“由于先进的计算工具,我们可以利用大量现有的癌症数据。这项研究显示了这些数据集如何带来新的见解,这些见解有可能改善患者的预后。

研究人员将继续这项工作,包括研究他们的基因特征是否也可用于预测哪些患者最有可能从免疫疗法中受益。虽然这种基因特征针对肺癌进行了优化,但该方法可用于开发其他癌症的特征。

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